Rønnes ældste historie ligger hen i mørke, men det er troligt, at der omkring år 1000 var bygget måske en snes huse i klynge omkring havnen og den nuværende kirkeplads. Det lille fiskerleje var anlagt et gunstigt sted, hvor kysten kunne besejles. Neden for bakken strakte to undersøiske rev sig ud i havet, og inden for revene var ,,trindelen" en lav stengrund hvor skibene kunne kaste anker. Forstranden var lang og flad, så fiskerbådene kunne trækkes på land uden stort besvær. Det var fiskere og landbrugere, der havde bygget ved de beskyttende rev.
Man skal op i 1200 Ã¥rene, før historiske kilder og arkæologiske vidÂnesbyrd giver oplysninger om byen. I slutningen af 1200 Ã¥rene opførÂtes et lille kapel viet de søfarendes helgen Sct. Nicolaus pÃ¥ det sted, hvor Rønne kirke nu ligger, og i 1327 fik byen købstadsrettigheder. Rønne var med andre ord blevet sÃ¥ stor, at byen lidt efter lidt fik egen styrelse med borgmester og rÃ¥d samt egen domsmyndighed og kongelige privilegier for købmændene og hÃ¥ndværkerne. Det var kongen, der gav købstaden privilegier, men det hindrede ikke, at byen indtil omkring 1300 pÃ¥ skift havde været underlagt forskellige herrer: kongen, ærkebiskoppen i Lund og nordtyske fyrster. Især tyskerne var interesserede i Bornholm pÃ¥ grund af øens placering ved den vigtige vest østlige handelsvej i Østersøen.
Gotland var midtpunkt i denne handel, men Rønne var en bekvem mellemstation pÃ¥ vejen til Visby. Købmændene fra hansestaden Greifswald slog sig ned i Rønne et tidligt tidspunkt, og inden 'ar 1400 havde de et ,gilde", som ydede beskyttelse, nÃ¥r de om sommeren søgte byen og rejste deres handelsboden Samtidig blev Bornholm underlagt ærkebiskoppen, der var herre over øen til 1522. Greifswalderne fik i 1433 eget kapel, som formentlig udgjorde en del af Rønne kirke. Endvidere fik greifswalderne et kompagnihus opført. Rønne tog til i udstrækning og indbyggertal. I 1360 mÃ¥tte kirken udvides mod vest og en snes Ã¥r senere blev kirken tilsyneladende en selvstændig sognekirke, frigjort fra tilknytningen til moderkirken i Knudsker. Med byens større betydning blev handelsbyerne ved ØsterÂsøen stadig mere interesseret i at fÃ¥ fodfæste pÃ¥ Bornholm. I fredstid betød denne interesse handel og omsætning, i ufredsÃ¥r plyndring og brandskatning.
Bornholm blev flere gange i begyndelsen af 1500ÂÃ¥rene overfaldet af lübeckerne, der plyndrede og hærgede, hvor de trængte frem, og krævede store skatter af øens befolkning.